Seperi u Hrvatskoj velikom su većinom Hrvati (iz okolice Dubrovnika), a bitno manje i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Šibeniku i Dubrovniku.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 20 Sepera u 8 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 30, pa se njihov broj smanjio za 20 posto. Prisutni su u samo pet hrvatskih naselja i to u Pločicama u okolici Dubrovnika (<10), Šibeniku (<5), Velikoj Gorici (<5), Vodicama (<5), te u Sonkoviću (<5).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko deset puta, a prvi put 1917. godine u izvoru Imenik dostojanstvenika, činovnika i javnih bilježnika.