Šaponje u Hrvatskoj većinom su Srbi, najvećim dijelom iz okolice Benkovca, ali su često i Hrvati (iz Benkovca). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Zadru i Benkovcu. U Dobropoljcima u okolici Benkovca svaki šesti stanovnik prezivao se Šaponja.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 240 Šaponja u 120 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 360, pa se njihov broj smanjio za 30 posto. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 21 gradu i 23 manja naselja, najviše u Zadru (40), Rijeci (20), Zagrebu (10), Splitu (10), te u Biogradu (10).
Izvan Hrvatske
Prezime Šaponja (uključujući: Saponja, Saponia i Saponya) prisutno je u 6 država na dva kontinenta. Prezime "Saponja" nosi manji broj osoba u Americi.