Stojakovići u Hrvatskoj većinom su Hrvati, dobrim dijelom iz Našica, a često su i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Našicama i Sisku. U Ljubini u okolici Hrvatske Kostajnice svaki šesti stanovnik prezivao se Stojaković.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 840 Stojakovića u 400 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 1100, pa se njihov broj smanjio za 30 posto. Prisutni su u gotovo svim hrvatskim županijama, u 50 gradova i 105 manjih naselja, najviše u Zagrebu (105), Sisku (65), Osijeku (45), Rijeci (35), te u Karlovcu (30).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko trideset puta, a prvi put 1750. godine u izvoru Porezni popis iz 18. stoljeća.