Prezime Pustaj u pravilu u Hrvatskoj nose Hrvati, najvećim dijelom iz okolice Jastrebarskog, a vrlo rijetko i Mađari. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Zagrebu i u okolici Jastrebarskog. U Repišću u okolici Jastrebarskog svaki četvrti stanovnik prezivao se Pustaj.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 150 Pustaja u 60 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 230, pa se njihov broj smanjio za 30 posto. Prisutni su u osam hrvatskih županija, u deset gradova i deset manjih naselja, najviše u Repišću u okolici Jastrebarskog (65), Zagrebu (20), Gornjem Desincu (15), Jastrebarskom (<10), te u Dalju u okolici Vinkovaca (<10).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..