Prezime Pupek u Hrvatskoj nose Hrvati, dobrim dijelom iz Novog Marofa. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Zagrebu i Novom Marofu.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 60 Pupeka u 30 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 60, pa je njihov broj ostao podjednak. Prisutni su u sedam hrvatskih županija, u jedanaest gradova i šest manjih naselja, najviše u Zagrebu (25), Križevcima (<10), Novom Marofu (<10), Kamenoj Gorici (<10), te u Varaždinu (<10).
Izvan Hrvatske
Prezime Pupek (uključujući: Pupeck, Puppek) prisutno je u 14 država širom svijeta. Prezime "Pupek" nosi oko 500 osoba u Poljskoj, približno 200 u Americi, te manji broj osoba u Mađarskoj. "Puppek" nosi nekoliko osoba u Americi. "Pupeck" nosi nekoliko osoba u Americi.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 1906. godine u izvoru Ljetopis društva Svetog Jeronima..