Pezeri u Hrvatskoj gotovo su u potpunosti Hrvati, najvećim dijelom iz Srednje Bosne, a prema nekim izvorima iz Hercegovine. Vrlo rijetko su i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Srednjoj Bosni (područje Kaknja) i u Hercegovini (područje Gruda). U Pepelarima u Srednjoj Bosni gotovo svaki stanovnik prezivao se Pezer.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 350 Pezera u 150 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 20, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 34 grada i 24 manja naselja, najviše u Zagrebu (75), Slavonskom Brodu (50), Đakovu (20), Rijeci (15), te u Vinkovcima (15).
Izvan Hrvatske
Najmanje 13 obitelji s ovima prezimenom iselilo je iz Hrvatske u: Njemačku (5), Austriju (3), Ameriku (2), Švicarsku (2), te u Kanadu (1). Prezime Pezer prisutno je u 17 država na četiri kontinenta. Prezime "Pezer" nosi oko 100 osoba u Njemačkoj, manji broj u Americi, te manji broj osoba u Kanadi.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko pet puta, a prvi put 1906. godine u izvoru Ljetopis društva Svetog Jeronima..