U Hrvatskoj danas živi oko 60 Perneka u 20 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 90, pa se njihov broj smanjio za 30 posto. Prisutni su u šest hrvatskih županija, u šest gradova i četiri manja naselja, najviše u Zagrebu (25), Varaždinu (15), u Brezovoj Gori (10) i Cvetlinu (<5) u okolici Lepoglave, te u Gornjem Macelju u okolici Krapine (<5).
Izvan Hrvatske
Prezime Pernek prisutno je u 14 država na četiri kontinenta. Prezime "Pernek" nosi oko 100 osoba u Turskoj, manji broj u Austriji, te manji broj osoba u Americi.