Prezime Mrkalj većinom u Hrvatskoj nose Hrvati, dobrim dijelom iz bosanske Posavine, ali često i Srbi te vrlo rijetko i Bošnjaci. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u okolici Jastrebarskog i u bosanskoj Posavini (područje Bosanskog Broda). U Sjeničaku Lasinjskom u okolici Jastrebarskog svaki sedmi stanovnik prezivao se Mrkalj.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 170 Mrkalja u 90 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 360, pa se njihov broj prepolovio. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 19 gradova i 17 manjih naselja, najviše u Karlovcu (30), Slavonskom Brodu (25), Zbjegu u okolici Pleternice (15), Sjeničaku Lasinjskom u okolici Jastrebarskog (15), te u Puli (<10).
Izvan Hrvatske
Prezime Mrkalj (uključujući: Merkali, Mrkali) prisutno je u 13 država na četiri kontinenta. Prezime "Mrkalj" nosi oko 50 osoba u Kanadi i manji broj u Americi.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko pet puta, a prvi put 1917. godine u izvoru Imenik dostojanstvenika, činovnika i javnih bilježnika.