Milankovići u Hrvatskoj većinom su Srbi, dobrim dijelom iz okolice Drniša, ali su često i Hrvati (iz Novigrada). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Zagrebu i u okolici Drniša. U Baljcima u okolici Drniša svaki peti stanovnik prezivao se Milanković.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 330 Milankovića u 170 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 560, pa se njihov broj smanjio za 40 posto. Prisutni su u gotovo svim hrvatskim županijama, u 34 grada i 40 manjih naselja, najviše u Zagrebu (70), Vukovaru (20), Osijeku (15), Slavonskom Brodu (15), te u Boboti u okolici Vukovara (10).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko deset puta, a prvi put 1750. godine u izvoru Porezni popis iz 18. stoljeća.