Markote u Hrvatskoj su Hrvati, najvećim dijelom iz Hercegovine, a prema nekim izvorima iz Dalmacije, pa čak i Italije. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Hercegovini (područje Posušja) i u Gradu Metkoviću.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 600 Markota u 230 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 170, pa se njihov broj više nego utrostručio. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 37 gradova i 34 manja naselja, najviše u Zagrebu (130), Rogotinu (60), Pleternici (50), Metkoviću (45), te u Splitu (45).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..