Isakovići u Hrvatskoj pretežito su Hrvati, dobrim dijelom iz Nove Gradiške, a često su i Bošnjaci (iz bosanske Posavine). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Novoj Gradiški i u bosanskoj Posavini (područje Brčkog). U Donjoj Vraci u Srednjoj Bosni svaki peti stanovnik prezivao se Isaković.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 130 Isakovića u 60 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 10, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 16 gradova i 13 manja naselja, najviše u Zagrebu (25), Sisku (20), Gunji u okolici Županje (20), Puli (10), te u Novoj Gradiški (<10).