Duje u Hrvatskoj gotovo su u potpunosti Hrvati (iz Srednje Bosne), a rijetko i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Srednjoj Bosni (područje Maglaja) i u Srednjoj Bosni (područje Novog Travnika).
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 70 Duja u 30 domaćinstava. Prisutni su u devet hrvatskih županija, u dvanaest gradova i osam manjih naselja, najviše u Grubišnom Polju (10), Sesvetama (<10), Suhopolju u okolici Virovitice (<10), Zagrebu (<10), te u Trogiru (<10).