U Hrvatskoj danas živi oko 40 Bonija u 30 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 60, pa se njihov broj smanjio za 30 posto. Prisutni su u šest hrvatskih županija, u sedam gradova i osam manjih naselja, najviše u Viškovcima u okolici Đakova (10), Dardi u okolici Osijeka (<10), Rijeci (<10), Đakovu (<5), te u Zmajevcu u okolici Belog Manastira (<5).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..