Bačkonje u Hrvatskoj većinom su Hrvati (iz Grada Jastrebarskog), a nešto manje i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Zagrebu i Kninu.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 40 Bačkonja u 20 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 50, pa se njihov broj smanjio za 30 posto. Prisutni su u pet hrvatskih županija, u šest gradova, najviše u Zagrebu (25), Strmici (<10), Jastrebarskom (<5), Vodicama (<5), te u Markovcu Našičkom (<5).
Izvan Hrvatske
Prezime Bačkonja prisutno je u tri države na dva kontinenta. Prezime "Backonja" nosi manji broj osoba u Americi.