Prezime Bakšaj u Hrvatskoj nose Hrvati, većim dijelom iz Lepoglave. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Varaždinu i Lepoglavi.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 130 Bakšaja u 60 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 110, pa se njihov broj povećao za 20 posto. Prisutni su u devet hrvatskih županija, u osam gradova i 17 manjih naselja, najviše u Varaždinu (35), Zagrebu (30), Budinščini u okolici Zlatara (10), Ivankovu u okolici Vinkovaca (10), te u Bjelovaru (<10).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..