Bajukovi u Hrvatskoj uglavnom su Hrvati (iz okolice Nina), rijetko i Slovenci (iz Podgorice, Crna Gora). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Zagrebu i Karlovcu.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 30 Bajukova u 20 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 30, pa je njihov broj ostao podjednak. Prisutni su u sedam hrvatskih županija, u sedam gradova i šest manjih naselja, najviše u Zagrebu (<10), otoku Viru u okolici Nina (<10), Rijeci (<5), Zadru (<5), te u Slavonskom Brodu (<5).