Babajevi u Hrvatskoj velikom su većinom Hrvati (iz Grada Našica), a bitno manje i Albanci (iz Grada Knina). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Našicama i u Kosovu. U Vukojevcima u Gradu Našicama svaki šezdeseti stanovnik prezivao se Babaj.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 30 Babaja u 12 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 20, pa se njihov broj povećao za 60 posto. Prisutni su u šest hrvatskih županija, u šest gradova i četiri manja naselja, najviše u Našicama (<10), Ivanić-Gradu (<5), Đurđenovcu u okolici Našica (<5), Sisku (<5), te u Petrinji (<5).