Ajderi u Hrvatskoj većinom su Srbi, a podjednako mogu biti i Hrvati (iz okolice Ogulina). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Rijeci i u Srednjoj Bosni (područje Kiseljaka). U Šahinovićima u Srednjoj Bosni svaki deveti stanovnik prezivao se Ajder.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 20 Ajdera u 9 domaćinstava. Prisutni su u četiri hrvatske županije, tri grada i četiri manja naselja, najviše u Dedinu (10), Zagrebu (<10), Lokvama u okolici Delnica (<5), Delnicama (<5), te u Gomirju (<5).