Zekonjići u Hrvatskoj velikom su većinom Hrvati (iz Grada Vodica), a bitno manje i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Šibeniku i Vodicama. U Gaćelezima u Gradu Vodicama svaki četrdeseti stanovnik prezivao se Zekonjić.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 30 Zekonjića u 9 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 20, pa se njihov broj povećao za 70 posto. Prisutni su u samo pet hrvatskih naselja i to u Vodicama (10), Gaćelezima (<10), Šibeniku (<10), te u Cabuni (<5) i Lukaču (<5) u okolici Virovitice.
Izvan Hrvatske
Prezime Zekonjić prisutno je u tri države na dva kontinenta.