Vojnikovići u Hrvatskoj velikom su većinom Hrvati (iz Grada Požege), a bitno manje i Bošnjaci (iz Bosanske Krajine). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Zagrebu i u Bosanskoj Krajini (područje Prijedora). U Bišćanima u Bosanskoj Krajini svaki peti stanovnik prezivao se Vojniković.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 50 Vojnikovića u 30 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 20, pa se njihov broj više nego udvostručio. Prisutni su u šest hrvatskih županija, u devet gradova i tri manja naselja, najviše u Zagrebu (20), Puli (<10), Požegi (<5), Malom Lošinju na otoku Lošinju (<5), te u Velikoj Mlaci (<5).