Stojnovići u Hrvatskoj često su Srbi, većim dijelom iz okolice Vukovara, a u manjem broju su i Hrvati. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Osijeku i u okolici Osijeka.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 80 Stojnovića u 50 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 230, pa se njihov broj višestruko smanjio. Prisutni su u osam hrvatskih županija, u deset gradova i 15 manjih naselja, najviše u Čepinu u okolici Osijeka (15), Markušici u okolici Vinkovaca (15), Zagrebu (10), Negoslavcima u okolici Vukovara (10), te u Orahovici (<10).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..