Runjajići u Hrvatskoj relativnom su većinom Hrvati, a podjednako mogu biti i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u okolici Knina i u Gradu Kninu. U Otonu u okolici Knina svaki devedeseti stanovnik prezivao se Runjajić.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi svega nekoliko Runjajića u samo šest domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 20, pa se njihov broj prepolovio. Prisutni su u četiri hrvatske županije, tri grada i jednom manjem naselju, najviše u Blatu na otoku Korčuli (<5), Hrvatskoj Kostajnici (<5), Vinkovcima (<5), te u Trogiru (<5).
Izvan Hrvatske
Prezime Runjajić prisutno je u pet država na dva kontinenta. Prezime "Runjajic" nosi nekoliko osoba u Italiji i nekoliko osoba u Americi.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 1917. godine u izvoru Imenik dostojanstvenika, činovnika i javnih bilježnika.