Prezime Pernjek u Hrvatskoj nose Hrvati, najvećim dijelom iz Krapine. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Krapini i Zagrebu.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 150 Pernjeka u 60 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 90, pa se njihov broj povećao za 60 posto. Prisutni su u sedam hrvatskih županija, u jedanaest gradova i 14 manja naselja, najviše u Zagori (30), Krapini (25), Donjem Macelju u okolici Krapine (20), Podgori Krapinskoj (15), te u Zagrebu (15).
Izvan Hrvatske
Najmanje dvije obitelji s ovima prezimenom iselile su iz Hrvatske u Ameriku (1) i Njemačku (1). Prezime Pernjek prisutno je u dvije države na dva kontinenta.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..