Pernari u Hrvatskoj su Hrvati, najvećim dijelom iz okolice Senja (Brinje), a prema nekim izvorima iz Novigrada kraj Zadra. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u okolici Senja i u Gradu Zagrebu.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 830 Pernara u 340 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 900, pa se njihov broj smanjio za 10 posto. Prisutni su u gotovo svim hrvatskim županijama, u 51 gradu i 86 manjih naselja, najviše u Zagrebu (205), Sisku (35), Slavonskom Brodu (30), Križpolju u okolici Senja (25), te u Dugom Selu (25).
Izvan Hrvatske
Najmanje 17 obitelji s ovima prezimenom iselilo je iz Hrvatske u: Francusku (7), Njemačku (4), Australiju (2), Ameriku (2), Švicarsku (1), te u Austriju (1). Prezime Pernar prisutno je u 11 država na četiri kontinenta.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko dvadeset puta, a prvi put 1679. godine u izvoru Matične knjige Katoličke crkve.