Pajnogači u Hrvatskoj gotovo su u potpunosti Hrvati (iz okolice Čakovca), a rijetko i Slovenci (također iz okolice Čakovca). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Čakovcu i u okolici Čakovca.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 40 Pajnogača u 13 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 10, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u dvije hrvatske županije, tri grada i četiri manja naselja, najviše u Brezju u okolici Čakovca (15), Čakovcu (<10), u Nedelišću (<5) i Lopatincu (<5) u okolici Čakovca, te u Varaždinu (<5).
Izvan Hrvatske
Najmanje jedna obitelj s ovima prezimenom iselila je iz Hrvatske u Ameriku. Prezime Pajnogač prisutno je u ovom obliku samo u Hrvatskoj.