Nikšići u Hrvatskoj pretežito su Hrvati, najvećim dijelom iz Gospića, a prema nekim izvorima iz Hercegovine (tromeđa između Čapljine, Međugorja i Ljubuškog). Rijetko su i Srbi, te Bošnjaci (zapadna Bosne). U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u gradovima Gospiću i Zagrebu. U Širokoj Kuli u Gradu Gospiću svaki četvrti stanovnik prezivao se Nikšić.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 1100 Nikšića u 480 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 1300, pa se njihov broj smanjio za 10 posto. Prisutni su u svim hrvatskim županijama, u 64 grada i 101 manjem naselju, najviše u Zagrebu (250), Osijeku (60), Rijeci (50), Vukovaru (40), te u Sincu (40).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko pedeset puta, a prvi put 1750. godine u izvoru Porezni popis iz 18. stoljeća.