Mujkanovići u Hrvatskoj pretežito su Bošnjaci, većim dijelom iz Bosanske Krajine, ali su često i Hrvati. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Bosanskoj Krajini (područje Prijedora) i u Gradu Zagrebu. U Bašićima u Istočnoj Hercegovini gotovo svaki stanovnik prezivao se Mujkanović.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 250 Mujkanovića u 110 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 20, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u gotovo svim hrvatskim županijama, u 32 grada i 39 manjih naselja, najviše u Zagrebu (115), Rijeci (25), Puli (20), Labinu (<10), te u Lučkom (<10).
Izvan Hrvatske
Najmanje jedna obitelj s ovima prezimenom iselila je iz Hrvatske u Ameriku. Prezime Mujkanović (uključujući: Mujkanovic, Muykanovich) prisutno je u 20 država na četiri kontinenta. Prezime "Mujkanovic" nosi oko 300 osoba u Americi, približno 200 u Austriji, te oko 80 osoba u Švedskoj.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..