Markotići u Hrvatskoj su Hrvati, većim dijelom iz Vrgorca, a prema nekim izvorima iz prezime potječe iz Crne Gore. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Hercegovini (područje Mostara) i u bosanskoj Posavini (područje Bosanskog Šamca). U naseljima Kornica i Riječani Donji u bosanskoj Posavini svaki deseti stanovnik prezivao se Markotić.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 600 Markotića u 250 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 230, pa se njihov broj više nego udvostručio. Prisutni su u gotovo svim hrvatskim županijama, u 37 gradova i 55 manjih naselja, najviše u Zagrebu (125), Osijeku (50), Vrgorcu (40), Gundincima u okolici Đakova (40), te u Splitu (40).
Izvan Hrvatske
Prezime Markotić (uključujući: Markotic, Markotich) prisutno je u 13 država na četiri kontinenta. Prezime "Markotic" nosi oko 90 osoba u Americi, približno 70 u Kanadi, te manji broj osoba u Njemačkoj.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko deset puta, a prvi put 1917. godine u izvoru Imenik dostojanstvenika, činovnika i javnih bilježnika.