Prezime Ilišin u Hrvatskoj nose Hrvati, dobrim dijelom iz bosanske Posavine. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u bosanskoj Posavini (područje Bosanskog Novog) i u Gradu Našicama. U Donjim Agićima u bosanskoj Posavini svaki osmi stanovnik prezivao se Ilišin.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 110 Ilišina u 30 domaćinstava. Prisutni su u deset hrvatskih županija, u osam gradova i 14 manja naselja, najviše u Đurđenovcu u okolici Našica (20), Našicama (15), Lipovljanima u okolici Novske (15), Osijeku (<10), te u Velimirovcu (<10).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..