Hamonajeci u Hrvatskoj gotovo su u potpunosti Hrvati (iz okolice Bjelovara), a rijetko i Ukrajinci (iz Grada Čakovca).Prezime Hamonajec nose osobe iz Hrvatske i Slovenije (okolica Maribora).Svi nositelji prezimena Hamonajec ( i oni iz Slovenije) potječu iz mjesta Kuzminec u župi Mihovljan. U matičnim knjigama župe Mihovljan prezime Hamonajec javlja se početkom 19. stoljeća u obliku Homonnayetz. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Gradu Čakovcu i u okolici Krapine.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 30 Hamonajeca u 11 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 50, pa se njihov broj smanjio za 40 posto. Prisutni su u osam hrvatskih županija, u osam gradova i tri manja naselja, najviše u Ivanić-Gradu (<10), Mihovljanu (<10), Stanićima u okolici Bjelovara (<10), Čakovcu (<10), te u Križevcima (<5).
Izvan Hrvatske
DNK analiza podrijetla jednog nositelja prezimena pokazuje 61,6 % poljskog podrijetla (okolica Krakova), 22 % Balkana (Hrvatska i Slovenija).