Ganibegovići u Hrvatskoj velikom su većinom Hrvati (s otoka Raba), a bitno manje i Bošnjaci. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Srednjoj Bosni (područje Sarajeva) i u Bosanskoj Krajini (područje Šipova). U Vražiću u Bosanskoj Krajini svaki treći stanovnik prezivao se Ganibegović.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 10 Ganibegovića u samo četiri domaćinstva. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 0, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u samo tri hrvatska grada i to u Palitu na otoku Rabu (<5), Puli (<5), te u Salopek Selu (<5).
Izvan Hrvatske
Prezime Ganibegović prisutno je u 13 država na četiri kontinenta. Prezime "Ganibegovic" nosi oko 50 osoba u Švedskoj, manji broj u Americi, te manji broj osoba u Keniji.