Fajkovići u Hrvatskoj velikom su većinom Hrvati (iz Grada Bakra), bitno manje Bošnjaci (s otoka Paga), te vrlo rijetko i Srbi. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u bosanskoj Posavini (područje Bosanske Gradiške) i u Cazinskoj Krajini, BiH (područje Bihaća). U Lašvi u Srednjoj Bosni svaki osmi stanovnik prezivao se Fajković.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 60 Fajkovića u 30 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 0, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u sedam hrvatskih županija, u deset gradova i tri manja naselja, najviše u Zagrebu (20), Puli (15), Rijeci (<10), Sinju (<5), te u Karlovcu (<5).
Izvan Hrvatske
Prezime Fajković (uključujući: Fajkovic, Faikovich i Faykovich) prisutno je u 17 država na četiri kontinenta.