U Hrvatskoj danas živi oko 30 Fagnjena u 12 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 40, pa se njihov broj smanjio za 20 posto. Prisutni su u četiri hrvatske županije, tri grada i sedam manjih naselja, najviše u Kamešnici u okolici Varaždinskih Toplica (<10), Križevcima (<5), Kalniku u okolici Varaždinskih Toplica (<5), Svetom Petru Orehovcu u okolici Križevaca (<5), te u Rijeci (<5).
Izvan Hrvatske
Prezime Fagnjen prisutno je u ovom obliku samo u Hrvatskoj.