Crnoje u Hrvatskoj su Hrvati, najvećim dijelom iz srednje Bosne, a prema nekim izvorima iz Crne Gore. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Srednjoj Bosni (područje Jajca) i u Bosanskoj Krajini (područje Mrkonjić Grada). U naseljima Karići i Barevo u Srednjoj Bosni svaki šesti stanovnik prezivao se Crnoja.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 420 Crnoja u 150 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 10, pa se njihov broj višestruko povećao. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 31 gradu i 49 manjih naselja, najviše u Zagrebu (60), Dugom Selu (20), Kutini (20), Čepinu u okolici Osijeka (15), te u Đakovu (15).
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje nekoliko puta, a prvi put 2007. godine u izvoru Enciklopedija hrvatskih prezimena..