U Hrvatskoj danas živi oko 10 Bekšića u 8 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 50, pa se njihov broj višestruko smanjio. Prisutni su u pet hrvatskih županija, tri grada i četiri manja naselja, najviše u Zagrebu (<5), Mirkovcu Brezničkom u okolici Novog Marofa (<5), Starigradu (<5), Tkalecu u okolici Novog Marofa (<5), te u Kloštar Ivaniću u okolici Ivanić-Grada (<5).
Izvan Hrvatske
Najmanje jedna obitelj s ovima prezimenom iselila je iz Hrvatske u Ameriku. Prezime Bekšić prisutno je u četiri države na dva kontinenta.