Prezime Šibenik u Hrvatskoj nose Hrvati, najvećim dijelom iz Zapadne Bosne. U prošlom stoljeću relativno najviše hrvatskih stanovnika s ovim prezimenom rođeno je u Zapadnoj Bosni (područje Livna) i u Gradu Zagrebu. U Lipovom Pesku u okolici Ogulina svaki četvrti stanovnik prezivao se Šibenik.
Rasprostranjenost
U Hrvatskoj danas živi oko 170 Šibenika u 70 domaćinstava. Sredinom prošlog stoljeća bilo ih je približno 100, pa se njihov broj povećao za 80 posto. Prisutni su u većini hrvatskih županija, u 15 gradova i 14 manja naselja, najviše u Sesvetama (30), Zagrebu (20), Lipovom Pesku u okolici Ogulina (15), Bjelovaru (15), te u Županji (15).
Izvan Hrvatske
Prezime Šibenik (uključujući: Sibenik, Shibenik) prisutno je u 7 država na tri kontinenta. Prezime "Sibenik" nosi manji broj osoba u Americi, manji broj u Kanadi, te manji broj osoba u Australiji.
U izvorima do sada obrađenim u projektu Acta Croatica, ime se spominje preko pet puta, a prvi put 1917. godine u izvoru Imenik dostojanstvenika, činovnika i javnih bilježnika.