Rafaeli se nalaze u općini Višnjan, u Istarskoj županiji na 150 metara nadmorske visine i prostiru se na površini od 2,84 km². Prema popisu iz 2011. godine, u Rafaelima živi samo osam stanovnika. Stanovništvo je pretežito hrvatsko (75%). Okolna naselja: Žikovići, Dekovići, Bačva, Pršurići, Radoši kod Višnjana, Vržnaveri, Milanezi, Bujarići, Ženodraga i Jehnići.