Modrino Selo se nalazi u općini Kistanje, u Šibensko-kninskoj županiji na 356 metara nadmorske visine i prostire se na površini od 13,72 km². Prema popisu iz 2011. godine, u Modrinom Selu živi 46 stanovnika. Stanovništvo je uglavnom srpsko (97%). Okolna naselja: Kolašac, Nunić, Bjelina, Biovičino Selo, Parčić, Zečevo, Dobropoljci, Medviđa, Gošić i Rodaljice.