Čista Mala se nalazi u Gradu Vodicama, u Šibensko-kninskoj županiji na 104 metra nadmorske visine i prostire se na površini od 14,41 km². Prema popisu iz 2011. godine, u Čistoj Maloj živi 131 stanovnik. Stanovništvo je najvećim dijelom srpsko (78%), te hrvatsko (22%). Okolna naselja: Čista Velika, Lađevci, Krković, Grabovci, Cicvare, Morpolača, Međare, Gaćelezi, Velim i Piramatovci.